يتولى المكتب المهام الاتية:

1-استثمار الطاقات والخبرات العلمية والتقنية المتوفرة لديه ووضعها في خدمة الخطط والمشاريع الاستثمارية.

2-توفير مستوى عال من الاستشارات والخبرات المتخصصة للقطاعات المساهمة في رفع الانتاج وتطويره وتحسين الاداء فيه ويشمل ذلك مختلف جوانب علوم البحار والعلوم البيئية وتنمية الثروة السمكية.

3 – توفير مستوى عال من الاستشارات العلمية والخبرات المتخصصة للمؤسسات المعنية بالشؤون البحرية ومستلزماتها من مرافئ وقنوات وتقديم الاستشارات القانونية المتعلقة بذلك.

4- التعاون مع المكاتب الاستشارية الاخرى في تنفيذ مشاريعها.